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과거 사실상 비과세 영역이었던 종교인들에 대해 세금을 매기는 것. 1970년대부터 추진해 왔으나 종교계, 특히 보수대형개신교계의 반발로 번번이 무산됐다. 문재인 정부 김동연 기획재정부 장관도 이낙연 국무총리의 지시에도 불구하고 과세를 유예하려 했으나 결국 2017년 9월 14일 개신교계와 극적으로 합의함으로써 과세는 이뤄지게 됐으나 온갖 특혜로 사실상 빈껍데기 과세라는 비판이 있다. 한편, 천주교는 소득신고를 하고 있고, 일부 진보성향 개신교 목사나 불교 스님도 세금을 이미 내고 있었다.

<h3>특혜 논란 항목</h3>